（1）选用抗病品种，这是简便易行、效果显著且无污染的防治措施。
（2）轮作倒茬可以使土壤中的丝黑穗病菌致病力不断下降，从而有效控制丝黑穗病的发生。
（3）种子处理。用多菌灵、三唑酮等杀菌剂拌种，可大大降低丝黑穗病的发病率。
（4）适时播种。高粱发芽到出苗前遇低温易感染丝黑穗病，因此，根据土壤的墒情和温度适期播种，可大大降低丝黑穗病发病率。一般应在5厘米耕层、地温稳定通过15℃以上方可播种。
（5）及时拔除病株。在病穗外膜尚未破裂之前，随时发现随时拔除，立即深埋，以防扩散。如能坚持大面积拔除病株2～3年，即可基本上控制丝黑穗病的发生。
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